El Balneari de Caldes de Boí, a 1.500 metres d'alçada, compta amb 37 brolladors d’aigües mineromedicionals de més de 16.000 anys d’història (el seu efecte terapèutic es remonta a l'època romana). Aquests brolladors es troben en l’extensa zona de jardins del balneari (24 ha) i des de l’Hotel Manantial s’ofereix una ruta a peu per descobrir-los.

Les aigües que s’extreuen d’aquestes fonts, amb temperatures que oscil·len entre els 4 i els 56 ºC, permeten realitzar més de 2.000 tècniques diàries amb finalitats terapèutiques. N’hi ha de clorurades, sulfurades, sulfatades i bicarbonatades (el sodi predomina en les aigües més calentes i el calci en les més fredes). 

El fet de disposar d’aquesta varietat d’aigües, raó per la qual el balneari apareix al llibre Guinness dels Rècords, permet oferir una àmplia carta de tractaments, tant per a nens com per a adults, que donen resposta a necessitats com: cures per a malalties reumatològiques, respiratòries, neurològiques, dermatològiques, de ronyó i vies urinàries, recondicionament cardiovascular, aprimament, aparell digestiu, anti-estrès i recondicionament físic post tractament oncològic.

Alguns dels tractaments estrella del Balneari són els següents:

1. Tractament reumatològic i traumatològic 

Indicat per artrosi, per seqüeles d'artritis reumatoide (no en periodoagudo), per post cirurgies de maluc, genolls... o patologies de la columna vertebral, entre d’altres. El tractament consisteix en una avaluació per part del metge del Balneari on s'indicarà específicament la combinació de les diferents tècniques. 
 
El tractament es basa en una teràpia de fang, en què s’aplica fang a les articulacions afectades, balneoteràpia en una banyera especial amb aigua altament sulfurada, rehabilitació a la piscina mitjançant la tècnica Bad Ragaz o gimnàstica aquàtica terapèutica. Si no fos possible realitzar la rehabilitació a l’aigua, es realitzarà en sec mitjançant gimnàstica terapèutica. Per calmar dolor s'utilitzaran tècniques de massatge tant en sec com en aigua, com poden ser el Massatge Subaquàtic, Massatge Vichy i Massatge mitjançant Gran Dutxa Universal.

2. Tractament respiratori 

Aquest tipus de teràpia està indicat tant per a nens com per a adults que pateixin patologies com rinitis, sinusitis, faringitis crònica, amigdalitis crònica, asma, malaltia obstructiva pulmonar crònica (MPOC), bronquitis crònica... 

El tractament basarà la seva actuació en estufes naturals d'aigua sulfurada, inhalacions i aerosols d'aigua sulfurada, rentats nasofaringis amb aigua sulfurada i/o bicarbonatada, exercicis respiratoris i fisioteràpia respiratòria
(Clapping i vibro teràpia).

3. Tractament dermatològic

Aquest tipus de teràpia està indicada per a nens i adults que pateixin dermatitis atòpica, psoriasi, cicatrius per cremades o altres causes. Bàsicament, el tractament consisteix en l'aplicació d'un fang dissenyat específicament per a ús en pell amb la barreja d'una bentonita, algues que creixen en les aigües sulfurades, i aigua sulfurada, combinant-ho amb estufes naturals de vapor d'aigua sulfurada i immersions en banyeres especials amb aigua sulfurada. En alguns casos és necessari l’aplicació de raigs a pressió per produir un efecte queratolític.

La diferenciació de les aigües 

Es denominen termals les aigües subterrànies que presenten una temperatura 5ºC superior a la temperatura mitjana dels aqüífers superficials de la zona; i minerals aquelles que posseeixen una concentració anormalment alta d'algunes substàncies químiques dissoltes. Si hi ha una combinació de les dues característiques, temperatura i concentració de minerals, tenim aigües termominerales i si se'ls reconeixen oficialment unes propietats curatives, reben el d’aigües mineromedicinals. El Balneari de Caldes de Boí té 37 fonts d’aigües mineromedicionals de diverses composicions i temperatures que poden ser utilitzades amb diferents finalitats terapèutiques.